[Seminar] Segmentation in echocardiography: is the problem finally solved ?

by Olivier Bernard, Professeur, Université de Lyon (INSA) et laboratoire CREATIS

Résumé: Depuis plusieurs années, les techniques de deep learning sont appliquées avec succès à l’imagerie médicale en général, et à l’échocardiographie en particulier. Loin d'être la panacée promise, ces méthodes ont permis des avancées majeures dans de nombreux domaines spécifiques comme l'acquisition d'images, l'analyse d'échocardiogramme, la segmentation et le suivi de structures anatomiques ou encore le guidage des utilisateurs. De plus, la combinaison de ces différentes techniques permet le déploiement de chaînes de traitement complètes et entièrement automatisées, permettant d'augmenter la fiabilité des mesures cliniques et de faciliter l'utilisation des échographes en dehors des hôpitaux. Dans mon exposé, je décrirai nos dernières contributions sur la segmentation de séquences échocardiographiques pour l'estimation automatique d'indices cliniques. Notre objectif ultime est de développer une méthodologie pour résoudre définitivement ce problème vieux de 30 ans. Cela comprend actuellement la conception de bases de données appropriées, l'exploitation du formalisme VAE et la modélisation de l'incertitude via le cadre CLIP.

Bio:  Olivier Bernard a obtenu son diplôme d'ingénieur électrique et son doctorat. de l'Université de Lyon (INSA), France, respectivement en 2003 et 2006. Il a été postdoctorant au sein du Groupe d'imagerie biomédicale de l'Institut polytechnique fédéral de Lausanne, EPFL, Suisse en 2007. Actuellement, il est professeur à l'Université de Lyon (INSA) et au laboratoire CREATIS en France. Il dirige également l’équipe de recherche Myriad, spécialisée dans l’analyse, la simulation et la modélisation d’images médicales. Ses intérêts de recherche actuels se concentrent sur l’analyse d’images grâce à des techniques d’apprentissage profond, avec des applications en imagerie cardiovasculaire, en imagerie du flux sanguin et en représentation de la population. Le professeur Bernard a également été rédacteur associé du livre IEEE Transactions on Image Processing.